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> Hm ... Schwere Kost. Hier in Berlin heißt es z. B. "Die
> S-Bahn-Station ist geschlossen". Übersetze ich nun
> "Station" mit Bahnhof, dann ist es der S-Bahn-Bahnhof

Der S-Bahnhof steht so im Duden. Grund für die Schreibweise ist, dass Bahnhof (oder Bahnsteig) kaum noch als Kompositum empfunden wird, weshalb sich die Schreibweise S-Bahn-Hof (oder S-Bahn-Steig) verbietet. Es gibt ja auch keinen Bushof, der heißt interessanterweise Busbahnhof.

Dopplungen wie S-Bahn-Bahnhof versucht das Sprachgefühl zu vermeiden. Die Schifffahrt mit Kreuzfahrtschiffen nennt man auch einfach Kreuzschifffahrt und nicht etwa Kreuzfahrtschifffahrt oder gar Kreuzfahrtschiff-Schifffahrt.

Bei S-Bahn-Station oder U-Bahn-Haltestelle greift dann wieder § 44 (1) der Rechtschreibregeln:

Man setzt einen Bindestrich zwischen allen Bestandteilen mehrteiliger Zusammensetzungen, in denen eine Wortgruppe oder eine Zusammensetzung mit Bindestrich auftritt [...]
http://www.korrekturen.de/regelwerk/schreibung_mit_bindestrich1b.shtml

Gruß
Julian