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> Im Jahr 1995 gründeten wir die Firma XY, den/der Grundstein für
> die heutige Firma AB.

> Ist hier Kasuskongruenz (den Grundstein) korrekt oder könnte man
> auch "der Grundstein" im Nominativ schreiben?

Ja, das kann man als Parenthese im Nominativ schreiben, was ich im konkreten Beispiel der Apposition im Akkusativ auch vorziehen würde, weil man ja sonst den Grundstein gründete.