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Du kannst auf keinen Fall nur das dritte Komma weglassen. "Als Vera hereinkommt" gehört zusammen. Wenn du das dritte Komma weglässt, gehört "hereinkommt" zu "ohne anzuklopfen" und nicht mehr zu "als Vera".

Wenn, dann müsstest du beide Kommata bei der Infinitivgruppe weglassen. Also: "Er hält inne, als Vera ohne anzuklopfen hereinkommt." Das ist von der Syntax her vertretbar (und man muss den Nebensatzcharakter von "ohne anzuklopfen" nicht zwingend bejahen). Allerdings ist das nach der amtlichen Regelung nicht zulässig. (§ 75 E1 gilt ganz ausdrücklich nicht für die Fallgruppe ohne + Infinitiv.) Nach amtlicher Regelung müssen also alle Kommata gesetzt werden. Man kann darüber diskutieren, ob man davon abweichen kann, dann aber nur so, dass man beide Kommata bei der Infinitivgruppe weglässt. Es ist in jedem Fall falsch, nur das dritte Komma wegzulassen.