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Der Duden ist nicht maßgeblich!
https://de.wiktionary.org/wiki/naja
Interjektionen sollten in einem Wort geschrieben werden. Tatsächlich werden sie das auf dieser Seite auch alle bis auf „o lala“ „meine Herren“ und „ach Gottchen“. Tatsächlich sollten auch diese in einem Wort geschrieben werden, was ich aus atheistischer Überzeugung bei „gottseidank“ im Deutschen übrigens auch ebenso konsequent mache wie bei „ojalá“ im Spanischen.