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> .....und deshalb akzeptierte er stillschweigend, wenn
> auch zähneknirschend, die neue Lage.

> Muss man hier ein Komma nach stillschweigend setzen, zwei
> wie rot hervorgehoben oder gar keins?

Antwort: MIT (paarigem) Komma

Die Konjunktionalfügung »wenn auch« leitet eine nachgestellte Erläuterung ein, die durch Komma abgetrennt bzw. in Kommas eingeschlossen wird (vgl. »wenn«, 5):

Das Zimmer ist billig, wenn auch klein und liegt im ersten Stock.
Mein Zimmer ist, wenn auch geringfügig, kleiner als deines.
Sie gelangte endlich, wenn auch unter großen Mühen, in das Haus.
Interessant, wenn auch nicht überraschend, ist das Ergebnis der Untersuchung.
Die meisten, wenn auch nicht alle, waren dafür.

Quelle:
Duden Ratgeber – Handbuch Zeichensetzung: Der praktische Ratgeber zu Komma, Punkt und allen anderen Satzzeichen, Abschnitt 184, 4