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> In unserer Klinik wird die Frage diskutiert, ob es korrekt
> heißt: Der Patient befindet sich "in der Station" oder
> "auf der Station" - was ist grammatikalisch richtig?

Ich würde auf sagen: Der Patient befindet sich auf der Station für Innere Medizin/Urologie/Onkologie usw. bzw. umgangssprachlich Der Patient befindet sich auf der Inneren/Urologie/Onkologie usw.

Vergleiche auch RugD:

auf / in / zu: Vor den Bezeichnungen von Behörden und anderen Dienststellen steht auf die Frage »wohin?« meist nicht in, sondern auf oder zu: ich gehe aufs / zum Rathaus, auf die / zur Post, aufs / zum Amtsgericht, auf die / zur Wache. Aber: Ich gehe auf / in mein Zimmer, aufs / ins Gymnasium. Gehst du schon in die / zur Schule? Auch auf die Frage »wo?« steht hier gewöhnlich auf, nicht in: Ich habe noch etwas auf dem Rathaus, auf der Post, auf dem Bürgeramt zu erledigen. Aber: Wie gefällt es dir denn auf dem / im Gymnasium / in der Schule? In Verbindung mit Länder- und Städtenamen steht auf die Frage »wo?« die Präposition in (in England, in Paris), bei Inselnamen steht auf (auf Sylt, auf der Mainau), bei Inselnamen, die zugleich Ländernamen sind, kann auf oder in stehen (auf / in Jamaika).

© Duden — Richtiges und gutes Deutsch, 6. Aufl. Mannheim 2007 [CD-ROM]

Und DWDS:

Statiọn, die; -, -en 〈lat.〉
[…]
Abteilung in einem Krankenhaus: eine chirurgische, psychiatrische, zahnärztliche S.; eine S. für Herzkranke; auf welcher S. liegt der Patient?; den Kranken auf eine andere S. verlegen

[<http://www.dwds.de/?woerterbuch=1&sh=1&qu=station>]

Gruß
Simon