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> Ihr könnt damit machen was ihr wollt.

> Steht vor "was" ein Komma?

Ja, "was" leitet einen Nebensatz ein.

> Sie wusste nicht, ob sie erfreut darüber sein sollte, von ihm zu
> hören oder nicht.

> Kommt ein Komma vor "oder"?

Ja. Wenn du es nicht setzt, bezieht sich das "oder nicht" auf "hören", es soll sich aber auf "erfreut sein" beziehen.

> Kann man "womit" benutzen, um sich auf zwei
> vorhergehende Substantive zu beziehen, wie z.B. in "Die
> Freude und Erleichterung, womit er sie begrüßte..."?
> "Mit denen" klingt als Alternative reichlich
> ungeschickt ;)

"Mit denen" klingt wirklich äußerst ungeschickt, "womit" ist aber auch nicht schöner. Du könntest "Freude und Erleichterung" als eine Einheit ansehen und "mit der" schreiben, wenn du dich nicht dazu aufraffen kannst, den Satz umzuformulieren.
Die allerbesten Grüße
Klaus