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> Aber ich frage mich, ob man auch S-Bahnlinie schreiben kann,
> weil man ja auch Bahnlinie und nicht Bahn-Linie schreibt.
Nein, S-Bahn-Linie. Es zerreißt die Bahnlinie sozusagen, da sowohl "Bahnlinie" als auch "S-Bahn" zusammengehören und im Kompositum dann nicht die eine Zusammengehörigkeit stärker gewichtet werden darf als die andere Zusammengehörigkeit. Äh, klar?
Vielleicht macht es folgendes Beispiel deutlich: Du schreibst ja auch "Ohrenarzt", aber "Hals-Nasen-Ohren-Arzt" und nicht etwa "Hals-Nasen-Ohrenarzt".
Grüße
Julian