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> Die Sicherheitsprobleme beim Online-Buchhändler sind größer
> als angenommen.
Hier setzt man kein Komma.
> Die Sicherheitsprobleme beim Online-Buchhändler sind größer
> als von Experten bisher angenommen.
Hier auch nicht. Wenn du aber unbedingt ein Komma setzen willst, kann ich dir folgende Umformulierung anbieten:
Die Sicherheitsprobleme beim Online-Buchhändler sind größer, als Experten bisher angenommen haben.
Gruß
Julian