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> und ich darf das Komma vor "steht" definiv" nicht
> weglassen?

Sie gehören zu jener Gruppe, die unmittelbar vor der ersten Schwelle, d.h. dem Übergang von X nach Y, steht.

Nein. Das schließende Komma nach einer Erläuterung entfällt nur, wenn sie in eine substantivische oder verbale Fügung einbezogen ist.

1. Dies ist nützliches, d. h. hilfreiches Forum.
2. Ich verharrte, bis er den Kaffee getrunken, also auch das Gift geschluckt hatte.

In deinem Beispiel ist "ersten Schwelle" eine substantivische Fügung. Die Erläuterung "d. h. dem Übergang von X nach Y" ist aber nicht einbezogen, sie steht nicht zwischen "ersten" und "Schwelle".

In folgendem Beispiel ist das anders (und deshalb fehlt das schließende Komma):

Sie gehören zu jener Gruppe, die unmittelbar vor der ersten, d. h. der am Übergang liegenden Schwelle steht.

Gruß

MG