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> Wenn er doch aber niemandem gegenübersitzt, sondern nur an
> diesem Platz gegenüber Platz genommen hat?
Es ist eine Frage der Betonung; siehe dazu Dudenregel D 48 und § 34(E1) des amtlichen Regelwerks:
www.duden.de/sprachwissen/rechtschreibregeln/getrennt-und-zusammenschreibung#D48
www.korrekturen.de/regelwerk/getrennt-_und_zusammenschreibung1b.shtml
In diesem Fall wird das die* Verbpartikel gegenüber- deutlich stärker betont als das Verb:
(...) da ihr Bruder direkt gegenübersaß
* Danke @Sara