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Gut, gibt's neben all den Duden-Aposteln noch Sonja, die die Sache von der richtigen Warte her betrachtet, nämlich der historischen.
Wer Grimm's Wörterbuch konsultiert, findet dort:
«Aufruhr. f. und m. ..bei der älteren sprache ist das Wort weiblich, wie man auch "die ruhr", in mehrfachem sinne sagt. ahd. hruora.»
Die angeführten Belege des Sprachgebrauchs zeigen fast ebenso oft Aufruhr als Femininum wie als Maskulinum.
Natürlich haben wir uns an die Vorschriften des Dudens in Sachen Rechtschreibung zu halten. Dieser hat (oder hätte) sich allerdings auch dem Sprachgebrauch zu beugen und der akzeptiert weithin "die Aufruhr", sowohl früher als auch heute (->unrepräsentativer Google-Test)