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> Sollte man im oben genannten Satz Kommas einfügen?
Ja, der Einschub muss mit Kommas abgetrennt werden:
Dies kann entweder mechanisch, zum Beispiel durch eine Schaufel, oder chemisch durch den Einsatz zugelassener Herbizide erfolgen.
Besser ist wohl "mit einer Schaufel" oder "durch Umgraben".
Gruß
Julian