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Hallo Oliver,
letztlich hast Du dir die Frage mit "Ob der Herr X aus Berlin stammt ..." schon selbst beantwortet: Man sagt "aus", wenn es darum geht, wo jemand herkommt, und "in", wenn es darum geht, wo jemand gerade ist. Und wegen ...
> der im Moment in Berlin in einem Büro sitzt
... ist also "in" richtig.
Grüße
Julian